В заключении еще раз процитирую старшего очень уважаемого товарища:
"...ЭКС, которую Вы пропагандируете, сама по себе вещь замечательная и перспективная. Не надо только от нее требовать невозможного (на данном этапе)..."
Удачи!

1. Земля не шар и не эллипсоид правильной формы. В классической навигации для описания наиболее правильно этой фигуры используется математическая модель - так называемый рефференс-эллипсоид (РЭ)(в России классическим считается РЭ Красовского). Но разговор сейчас не об этом, а о высоте антенны над уровнем моря, которая нужна для автоматического введения поправок к уровню, выдаваемому выбранным РЭ для данной точки поверхности Земли. По скольку мы имеем дело с банальным радиосигналом (извините - объясняю буквально на пальцах) - речь идет о точности определения места судна, а не о цвете заливки огня.

2. На судах приемо-индикаторы GPS используются не только для выдачи сигналов для ЭКС, но и для элементарного нанесения этих координат на бумажные карты и в судовом приемо-индикаторе может быть ВРУЧНУЮ активировано все что угодно (в зависимости от того, что написано на карте), начиная от GREEN HEEL заканчивая PULKOVO_1942 (Вы ее называете СК-42) опять же для получения точного полжения судна именно на бумажной карте. В этом свете Ваш тезис :"...В приемоиндикаторах, как я разобрался, используется всегда WGS-84, т.к. нашей СК-42 там просто нет...",- выглядит несколько странно. Может речь идет о приемнике GPS для ноутбука? Ошибочка между WGS84 и СК_42 может составлять до 150 м.
Лень щас лазать по сети, вот первые две попавшиеся ссылки на эту тему:
http://www.mirgps.info/nicety/nastroyki
http://www.rus-roads.ru/gps/help_ozi/datums.html

3. Если "размерения судна практически всегда прилетают от АИС" (прилетают не размерения судна, а расстояние от антенны до носа, от антенны до кормы, от антенны до левого борта и от онтенны до правого борта - т.е.координаты антенны), то при вырубании этого АИС размерения (читай - координаты антенны) тоже улетают, имеем голые географические координаты со своего GPS - т.е.точку. В Вашем случае "точка" имела вид контура судна.

Система координат, применяемая в нашей стране, названа не мной, а Правительством. Постановлением Совета Министров СССР от 7 апреля 1946 года № 760 на основе результатов выполненного уравнивания была введена единая система геодезических координат и высот на территории СССР - система координат 1942 года. http://www.spbtgik.ru/book/2128.htm Вы можете увидеть это название на отечественной карте в правом нижнем углу. СК-42, соответственно, сокращенное название, применяемое, кстати, в распоряжениях капитана порта. Мой тезис :"...В приемоиндикаторах, как я разобрался, используется всегда WGS-84, т.к. нашей СК-42 там просто нет…" означал, что в перечне систем координат, которые возможно применять в судовом конкретном приемоиндикаторе (их, систем координат, действительно очень много), нашей отечественной СК-42 я не нашел. Поэтому, естественно, судоводители используют за неимением нашей - WGS-84 (ну, не японскую же). А продвинутые судоводители вводят поправки перехода от WGS-84 к СК-42 для прямого нанесения координат на отечественные бумажные карты в СК-42. Вот это и нужно проверить на судне. Я встречал такие суда. К сожалению, вводят судоводители эти поправки и в приемоиндикаторы, выдающие данные в АИС.

По поводу размерений судна. Повторяю еще раз. В программу автоматически поступают от АИС размерения судна (длина и ширина), а также положение антенны, принимающей сигналы GPS (либо АИС, либо GPS-приемника, выдающего данные в АИС) для правильного рисования контура судна относительно антенны. Снимок вкладки настроек судна прилагается. К сожалению, данные на эту вкладку иногда не прилетают. Тогда приходится использовать возможность ручного ввода всех данных, в том числе и положение своего GPS-приемника. При пропадании координат от АИС, настройки судна никуда не пропадают. Поэтому я и написал, что продолжает ехать контур судна от своего приемника, а не символ судна в виде двух кружочков. Я про кружочки забыл.

г. vpropisnov! Большое спасибо за ваши разъяснения. Ни на одном судне мне не сумели пояснить какие координаты использует АИС.